开皇九年，二月末，晋王杨广留王韶镇守石头城，委以后事。同时，杨广下令各路伐陈大军班师回朝，并押送陈朝君臣一同上路。
三月己巳（初六），陈后主与其王公大臣从建康启程出发，直奔长安（隋朝都城大兴）。男女老少陆续上路，连绵不断，长达五百里。
一路上，杨广命人送上告捷露布，平陈胜利捷报传布至全国的四面八方。隋文帝命人划分出京城士民的宅第，内外修整，以待陈朝君臣，并派遣使者迎接犒劳，陈朝人讴咏隋帝之德，忘其亡国之痛。
使者还奏隋文帝道：“自陈后主以下，大小在路，五百里累累不绝。”
“陈朝以三代之隆，享国三十余年，及其亡国，竟到如此地步！”隋文帝嗟叹道。
四月己亥（十八日），隋文帝驾幸骊山温泉，亲自慰劳凯旋之师。
四月乙巳，三军凯旋入长安，献俘于太庙。陈叔宝及陈朝诸王侯将相，以及乘舆、服御、天文图籍等以次行列，在隋军铁骑围护下，跟随着晋王杨广和秦王杨俊之后，次第入城，列于庙庭之上。
隋朝百官大臣及四方宾客使者列于庙堂两边，先宣读露布，读毕众人再拜，山呼万岁，场面壮观盛大。
接着，隋文帝命人当众宣诏，拜晋王杨广为太尉，赐辂车、乘马、衮冕之服、玄圭、白璧。
翌日，隋文帝坐在广阳门城楼观阙上，宦官引领陈叔宝于前，及太子、诸王二十八人，以及陈国司空司马消难、尚书令江总、仆射袁宪、骠骑萧摩诃、护军樊毅、中领军鲁广达、领军将军任忠、吏部尚书姚察、侍中中书令蔡征、左卫将军樊猛，至尚书郎凡二百余人，陈朝君臣跪于门下，杨坚命纳言宣诏慰劳众人。
随后，内史令李德林宣旨，责备陈朝君臣不能相辅，以致灭亡。陈叔宝及其群臣皆惭愧恐惧，拜伏于地，莫能仰视，屏息不能对答。既而又宣布赦免他们。隋文帝下诏陈武帝、陈文帝、陈宣帝三帝之陵，总给五户分守。
陈国降臣跪听诏书之际，唯独原陈朝晋熙王陈叔文欣然而有自得之志。不久之后，陈叔文上表希望格外受恩：“昔在巴州，已先投诚，乞知此情，望异常例。”
隋文帝览表不悦，嫌弃其身为陈叔宝之弟，却不忠于国。然而，杨坚正欲笼络安抚江南，遂授陈叔文开府，拜宜州刺史。
四月庚戌，隋文帝驾临广阳门，大宴出征将士，颁赐各有差，自门外夹道陈列布帛等物，达于南郭，班赐各有差，凡用三百余万段布帛。辛亥，大赦天下。
不久前，晋王杨广在建康城内诛戮陈朝五佞，却不知都官尚书孔范、散骑常侍王瑳、王仪、御史中丞沈瓘（guàn）之罪，故而四人免于处罚；陈人至长安后，四月己未，隋文帝以此四人奸佞谄惑，并暴露其过恶，名为四罪人，统统流放至边裔，以谢吴越百姓。
孔范之罪此前已有提及；这王瑳、王仪一并出身琅邪王氏，王瑳刻薄贪鄙，忌害才能；王仪善于迎合人意、巴结奉承，曾献出二个女儿，以求亲昵。沈瓘险惨苛酷，发言邪谄，故四人同罪。
原陈国境内，免除赋税徭役十年，其余州免一年租赋。军人则免除徭役。选拔陈朝文武众才而用之。所得陈朝宫奴数千，可归者归之，其余则分赐将士及王公贵臣。
杨坚命陈朝乐户演奏亡陈女乐，并告诫公卿道：“此声似啼，朕闻之甚不喜，故与公等一听亡国之音，俱为长久鉴戒。”
四月壬戌，隋文帝以为天下一统，即可安享太平，于是，他踌躇满志地颁布“太平诏书”，其诏曰：
“往以吴越之野，群黎涂炭，干戈方用，积习未宁。今率土大同，含生遂性，太平之法，方可流行。……丧乱已来，缅将十载，君无君德，臣失臣道，父有不慈，子有不孝，兄弟之情或薄，夫妇之义或违，长幼失序，尊卑错乱。朕为帝王，志存爱养，时有臻道，不敢宁息。内外职位，遐迩黎人，家家自修，人人克念，使不轨不法，荡然俱尽。兵可立威，不可不戢，刑可助化，不可专行。禁卫九重之余，镇守四方之外，戎旅军器，皆宜停罢。代路既夷，群方无事，武力之子，俱可学文，人间甲仗，悉皆除毁。有功之臣，降情文艺，家门子侄，各守一经，令海内翕然，高山仰止。京邑庠序，爰及州县，生徒受业，升进于朝，未有灼然明经高第，此则教训不笃，考课未精，明勒所由，隆兹儒训。……朕君临区宇，于兹九载，开直言之路，披不讳之心，形于颜色，劳于兴寝。……见善必进，有才必举，无或噤默，退有后言。颁告天下，咸悉此意。”
平陈之后，投奔陈朝的司马消难至京师，隋文帝念及他与父亲杨忠的结拜之情，特免其死罪，发配为乐户。不过，乐户地位卑微，仅过二十余日，隋文帝又下令放免，再次以叔侄之礼引见，至于这对异姓叔侄说了什么，已然无从知晓。
司马消难回家后不久，就郁郁而终。他一生历经四朝，祖先是西晋总是，自己曾是北齐驸马，却被逼无奈而弃北齐投奔北周；后来成为北周国丈，见杨坚欲篡国，再次逃亡至陈朝，任司空这一虚职；最终虽入了隋朝，却难享清福，成为南北朝末年这一大时代下的悲剧人物。
陈朝尚书令江总入隋，为上开府仪同三司。
尚书仆射袁宪入隋，授使持节、昌州诸军事、开府仪同三司、昌州刺史。
陈朝名将、骠骑大将军萧摩诃入隋，授开府仪同三司。
护军将军樊毅随例入关，顷之即卒，未授官。
中领军鲁广达，曾率众与贺若弼死战，杀敌甚多。建康城失陷后，犹督残兵苦战不息，兵败被俘，依例入隋。
鲁广达悲于陈朝覆灭，思国成疾，拒绝医治，愤慨而卒，时年五十九。江总抚柩恸哭，执笔题其棺头，为诗曰：“黄泉虽抱恨，白日自流名。悲君感义死，不作负恩生。”
江总又为鲁广达制墓铭，其大意略为：“灾流淮海，险失金汤，时屯运极，代革天亡。爪牙背义，介胄无良，独摽忠勇，率御有方。诚贯皎日，气励严霜，怀恩感报，抚事何忘。”
领军将军任忠，率先投降韩擒虎，引领隋军入台城。其年入长安，隋授开府仪同三司，卒年七十七岁。
任忠去世后，隋朝并未赠官或追封，隋文帝出于帝王御人之术，警戒群臣道：“平陈之初，朕悔不杀任蛮奴。受人荣禄，兼当重任，不能横尸一死以徇国，却道自己无所用力，与弘演纳肝何其远也！”
这任忠，字奉诚，小名蛮奴，隋朝为了避太祖武元皇帝杨忠的名讳，而称其为任蛮奴。本文中出现的钟山与蒋山亦是同处地名。钟山，一名金陵山，又名紫金山，汉末秣陵尉蒋歆逐贼死于山下，吴大帝孙权封他为蒋侯。孙权祖父讳钟，遂将钟山更名为蒋山。
而“弘演纳肝”这一典故，载于《吕氏春秋》，形容臣忠于君，至死不渝。故事讲述的是春秋时期卫国大夫弘演，深受国君卫懿公器重，奉命出使未归。而卫懿公荒淫无道，宠幸宦官、宠爱仙鹤，终致好鹤亡国。
那日，狄人突然攻卫，杀卫懿公，尽食其肉，独舍弃其肝。后来，弘演回国为懿公收尸，但见血肉模糊，尸体零落不全，只有一肝尚存。弘演向肝哭拜道：“主公一世风光，如今无人收葬，亦武棺木，臣仅以此身为棺吧！”
说完，只见他拔出佩剑，剖开腹部，手取懿公之肝纳入腹中，随即倒地而亡。侍从将其尸体当作懿公的棺材，草草掩埋。
任忠虽晚节不保，其侄子任瑰却在史书上留下别样一笔。任忠之弟任七宝，出仕陈朝为定远太守，早卒，有子任瑰，任忠爱之，情逾己子，常称赞道：“吾子侄虽多，并为佣保（雇工）而已，门户所寄，惟在于瑰。”
任瑰十九岁，试守（实习之意）灵溪令。不久生前为衡州司马，都督王勇甚是敬重他，委以州府之务。
后来，隋师灭陈，任瑰劝王勇占据岭南，寻求陈朝宗室子孙，立以为帝，为陈朝复国。然而，王勇不听其言，并以岭外之地投降隋朝，任瑰乃弃官而去。
史臣曰：任忠虽勇决强断，而心怀反覆，诬绐君上，自踬其恶，鄙矣！至于鲁广达全忠守道，殉义忘身，盖亦陈代之良臣也。
陈朝另外一员猛将周罗睺，入关之后，隋文帝当众许以富贵。
“臣蒙受陈氏优厚待遇，陈朝沦亡，臣已无法报效故国。今蒙陛下所赐，能保全性命，已是荣幸，至于富贵荣禄，非臣所望也。”周罗睺垂泣而对答道。杨坚听闻此语，甚是器重他。
“闻公于郢、汉调兵，即知扬州可得。王师顺利渡江，果如所量。”贺若弼对周罗睺说道。
“若得与公周旋，胜负未可知也。”周罗睺笑答道。两位名将之言，纯属相互赞誉。
其年秋，周罗睺拜上仪同三司，鼓吹羽仪，送于宅第。早先，陈朝裨将（副将）羊翔归降于隋朝，成为攻打陈朝的领路人，入隋位至上开府，班列于周罗睺之上。
一日，韩擒虎于朝堂上对周罗睺戏言道：“公不知随机应变，而今立在羊翔之下，能无愧乎？”
“昔在江南，久闻公之美名，谓公乃天下节士（有节操的人）。今日所言，殊非忠臣义士之论。”周罗睺反驳道。韩擒虎闻言，面露羞愧之色。
起初，陈武帝初即位，其夜梦见有人自天而下，至太极殿前，北面而立，执玉策金字道：“陈氏五帝三十二年。”
陈叔宝在东宫为太子时，有妇人突入，高声唱道“毕国主”。陈后主称帝后，有一只一足鸟，集其殿庭，以嘴画地成文字，写道：“独足上高台，盛草变为灰。欲知我家处，朱门当水开。”
解者以为：“独足”，指陈后主独行无众。“盛草变为灰”，隋承火运，草得火而成灰，指陈政无秽，被隋火德所焚除也。后来，陈叔宝至长安，与其家属建馆于都水台上，所谓“上高台”、“朱门当水开”，其言皆验。
南梁末年，有童谣唱道：“可怜巴马子，一日行千里。不见马上郎，但见黄尘起。黄尘污人衣，皂荚相料理。”
时任南徐州刺史的陈霸先擒杀王僧辩，群臣以谣言奏闻称：“王僧辩本乘巴马以击侯景，马（繁体字为馬）上郎，王字也，尘谓陈也，意为陈氏当兴。” 不过，时人皆不解皂荚之意。
后来，陈灭于隋，说者以为江东称呼羖（gǔ）羊角为皂荚，隋氏姓杨。杨者，羊也，指陈终灭于隋。然则兴亡之兆，自有定数矣。
以上谶言见诸史书，各位看官稍作了解，不可深信。
陈叔宝入京朝见隋文帝，文帝赦免其罪，给赐甚厚，数次得以引见，班同三品官。杨坚每次设宴，总让陈叔宝参加，恐其伤心，而不许奏江南之音。杨坚虽给了陈叔宝特殊礼遇，但为防其有异心，而派人监守他。
一日，监守者启奏道：“陈叔宝说‘我时常赴宴，却无职位，入朝不便，愿得一官号’。”
“叔宝全无心肝。”隋文帝不禁失笑道。陈叔宝作为亡国之君，还乞求一官半职，杨坚自然不解。
未几，隋文帝又问监守者：“叔宝有何嗜好？”
“嗜食驴肉。”监守者对答道。
“每日饮酒多少？”
“与其子弟每日饮酒一石。”监守者又补充道，“陈叔宝日日饮酒，天天大醉，罕有清醒之时。”
“酒多伤身，须加以节制。”隋文帝大惊并叹息道。既而转念一想，又说道，“任他去吧，不然，何以度日？”
后来，陈叔宝随从隋文帝东巡，君臣登上芒山。叔宝侍饮而赋诗道：“日月光天德，山川壮帝居，太平无以报，愿上东封书。”并上表请求封禅，隋文帝优诏谦让不许。
其后，陈叔宝从驾至仁寿宫，常侍宴。隋文帝目送他离席，慨然长叹道：“陈国之败岂不由酒？有作诗的功夫，不如思安国事。当年贺若弼度京口，陈军密启告急，叔宝为饮酒，遂置之不理。高颎至建康之日，犹见密启在床榻下，尚未开封。此亦是可笑，盖天亡陈国也！前秦苻氏所征得国，皆荣贵其主。叔宝欲求名，不知违天命，朕若授官，乃违天意也。”
杨坚将陈叔宝作为皇帝来批评，而陈叔宝则视自己为风流才子，作诗谱曲是其正业，治理国家不过是偶一为之的副业而已。亡国后，陈叔宝寄情于酒，不作哀悼故国之诗，得以苟全性命，也算是一大幸事。
陈朝宗室子弟过多，且皆寓居京师大兴城，隋文帝恐他们聚众为乱，便下令将众人分置于诸州县，每岁赐以衣服等物。